要修改微信小程序项目的依赖项，你可以按照以下步骤操作：

1. 修改 package.json 文件

打开你的小程序项目的 package.json 文件，找到 "dependencies" 或 "devDependencies" 部分。在这里，你可以添加、删除或更新依赖项。

例如，如果你想添加一个新的依赖项，可以这样做：

"dependencies": {
  "new-dependency": "version"
}

如果你想更新一个现有的依赖项，可以修改其版本号：

"dependencies": {
  "existing-dependency": "new-version"
}

如果你想删除一个依赖项，可以直接从 package.json 文件中移除相应的条目。

1. 安装或更新依赖项

在命令行中，进入到你的小程序项目目录，然后运行以下命令来安装或更新依赖项：

npm install

这将根据 package.json 文件中的依赖项列表安装或更新相应的依赖。

1. 打包 npm（仅适用于生产环境）

如果你正在为生产环境准备小程序，请确保在微信开发者工具中打包 npm。点击菜单栏的 "工具" > "构建 npm"。这将生成一个名为 "miniprogram_npm" 的文件夹，其中包含你的小程序所需的依赖项。

1. 更新微信开发者工具配置

如果你的微信开发者工具配置文件（project.config.json）中有 packNpmManually 设置，请确保它仍然设置为 true。这样，每次构建小程序时，都会自动打包最新的 npm 依赖。

{
  "packNymManually": true,
  ...
}

1. 测试并验证更新

现在，你可以在微信开发者工具中预览和测试你的小程序，确保依赖项的修改没有引入任何问题。

注意：在修改依赖项时，请务必查看官方文档以了解可能的破坏性更改和新特性。如果有必要，你可能需要更新你的代码以适应这些更改。